Bio on 次世代コンピューティング研究室

共同研究をしているNational Cheng Kung Univ. のTsung-Yi Ho先生とのうち合わせ

Fri, 08 Mar 2013 16:36:17 +0900

2月27～3月1日にかけて、チュンさんとゲル先生が、共同研究をしているNational Cheng Kung Univ. のTsung-Yi Ho先生とのうち合わせに台湾の台南市にいきました。Ho先生の大学やそのまわりもいろいろ見てきました。とてもいいところなのでもう一度機会があったらいきたいと思いますので、行きたいかたは、ぜひBiochip党に入党を（山下先生談）。

Asia and South Pacific Design Automation Conference

Fri, 01 Feb 2013 16:26:37 +0900

1月22日～25日に横浜で行われたAsia and South Pacific Design Automation Conference でチュンさんが研究発表を行いました。学部生とは思えない発表で、その発表内容と発表に聞いていた山下先生を含めた会場の人たちは感動を覚えました。みなさんもぜひ英語を勉強してチュンさんレベルでの英語での発表をできるようになりましょう！！また、我が研究室の卒業生であるユリさんが会社からの研究発表を別のセッションで行っていました。それもあって、会議の後にユリさんとの飲み会もしました。ユリさんと会うことが久しぶりなこともあり、夜遅くまでいろいろ語り合いました。先輩とのこういう飲み会はいいものですね。

Tsung-Yi Ho, National Cheng Kung University

Fri, 20 Jan 2012 00:00:01 +0900

Bio党紹介ページ

Fri, 01 Apr 2011 00:00:14 +0900

Bio党とは？

近年発展しつつある、バイオチップに関する研究を行っています。この分野の世界的な研究者である台湾のTsung-Yi Hoさんと2012年から共同研究開始しました。あと、バイオ関係としてはRNA解析をGPUで行うプロジェクトも生命の西澤先生とたちあげつつあります。バイオチップはこれから大幅に需要がかなり拡大すると考えられています。

バイオチップとは

バイオチップとは，イメージ的には小さな科学実験室であるといわれる．小さいチップ上で試料や試薬など液体を扱うことで，科学反応を行う(混合をし、分析するなど)．この操作が、まさに「プログラミング」であり、高度なアルゴリズム設計を必要とされる。これによって、従来の生化学分析と比べると，多くの利点がもたらされる。・反応物の量を軽減できる・反応速度をはやくできる・ヒューマンエラーが少なくなる・器具のコストが下がる情報と関係ないと思ったあなた！甘い！この利用方法はきちんと確立されておらず、大規模なバイオチップをどのように設計するか、どのように利用するかは、高度なアルゴリズム開発とプログラム開発が必要です。そうです、あなたの研究がこの新しい分野に必要とされています！イメージ：従来の化学実験室バイオチップ

バイオチップの種類

・DNAアレイ・たんぱく質アレイ: 多数のDNA断片をガラス，プラスチックあるいはシリコン基板上に配置する．数万から数十万の遺伝子発見を一度に調べることが可能である． ・デジタルマイクロフルイディクスバイオチップ: 配列のような基盤上で試料を電力で誘導し，反応科学を実現する． ・コンティニュアスフローバイオチップ: 連続的な流体の流れに基づく．多くのバルブから構築．現在，デジタルマイクロフルイディクスとコンティニュアスフローバイオチップに関するテーマを研究している．

BioComputing党の研究テーマ

こんな研究テーマが考えられます・バイオチップの処理実行時間の最適化・バイオチップにおけるコンポーネント(ミキサー，フィルターなど)の数の最適化・チップにおけるコンテミネーション問題・サンプル(反応物)の量を少なくするほかのアイデアがあれば大歓迎